RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 JPT2Q9H910 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 TENM3Q9P273 2699 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WWL8 130 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-53P01767 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYGDP07320 174 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 EVI2AP22794 236 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 SLAQ13239 276 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB4BP61018 213 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZTC4 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 GATD1Q8NB37 220 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 FRZBQ92765 325 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF479Q96JC4 524 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM210BQ96KR6 192 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 YPEL4Q96NS1 127 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 F5H697 171 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 F5H768 121 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 SCO1O75880 301 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DQA1P01909 254 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 MT-ND6P03923 174 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 MGPP08493 103 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF56Q15929 161 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 H7C1H1 209 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 HTN3P15516 51 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00315P59091 139 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 FHL2Q14192 279 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 AMN1Q8IY45 258 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO0255Q9UI72 69 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PAX4O43316 350 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB4AP20338 218 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXA5P20719 270 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOHQ15669 191 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 MRAP2Q96G30 205 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF185Q96GF1 192 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 COLCA2A8K830 154 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EQD1 137 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R17O96001 155 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 APCSP02743 223 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 PPBPP02775 128 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYBA4P53673 196 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BNG1 76 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 M0QY20 66 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB5AP20339 215 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 CKS2P33552 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZSN1 163 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 COL7A1Q02388 2944 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 NACAE9PAV3 2078 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0J9YY99 117 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 NUPR2A6NF83 97 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 ORMDL3Q8N138 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 NIT2Q9NQR4 276 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-208ENST00000462602 D6R8Y8 96 aa6.58□□□□□ -1.36
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