RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462410.5

TRAF5-204, Transcript of TNF receptor associated factor 5, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF5, Length 4,958 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5-204ENST00000462410 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.53□□□□□ -1.2
TRAF5-204ENST00000462410 TAL2Q16559 108 aa7.52□□□□□ -1.2
TRAF5-204ENST00000462410 STPG4Q8N801 248 aa7.52□□□□□ -1.2
TRAF5-204ENST00000462410 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 NDUFA1O15239 70 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 UBE2BP63146 152 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 CYYR1Q96J86 154 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 IGLL1P15814 213 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.52□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 Q6ZVH6 145 aa7.52□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.51□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 ZNF747Q9BV97 191 aa7.5□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.5□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.5□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.49□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 A0A0U1RRA0 63 aa7.49□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 TIRAPP58753 221 aa7.48□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 A0A096LPF7 62 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 XCL1P47992 114 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 Q6ZQT7 251 aa7.47□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 J3QQQ9 107 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 P0DMU3 169 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 FAM231AP0DMU4 169 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 FAM231CP0DMU5 169 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 KRTAP10-9P60411 292 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 CITED1Q99966 193 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 SIVA1O15304 175 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 FGF6P10767 208 aa7.47□□□□□ -1.21
TRAF5-204ENST00000462410 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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TRAF5-204ENST00000462410 PRAC2D3DTV9 90 aa7.46□□□□□ -1.22
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TRAF5-204ENST00000462410 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.46□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 PFN2P35080 140 aa7.46□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 SNAI2O43623 268 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 IGHV3-30P01768 117 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 IGHV3-33P01772 117 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 NPSP0C0P6 89 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 K7EN84 100 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAF5-204ENST00000462410 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.44□□□□□ -1.22
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