RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf52Q96A22 123 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 PTH2Q96A98 100 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 PARLQ9H300 379 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 NXPH4O95158 308 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYGDP07320 174 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB5CP51148 216 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SLAQ13239 276 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf223Q8N319 242 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 IL36BQ9NZH7 164 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPG2P98160 4391 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GZMBP10144 247 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 ASIPP42127 132 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR27Q6MZM9 219 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MANBALQ9NQG1 85 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WWL8 130 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BS24 57 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SIVA1O15304 175 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SNAI2O43623 268 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00694P0DN24 101 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL2P10415 239 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SRIP30626 198 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SSTP61278 116 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPWQ5EE01 88 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 SFRP2Q96HF1 295 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE12JA6NER3 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MWV9 139 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EN84 100 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R381 172 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00315P59091 139 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE1Q13065 139 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE4Q13068 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE5Q13069 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE13Q4V321 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MED9Q9NWA0 146 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 VAX2Q9UIW0 290 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE10A6NGK3 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y8G0 127 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCL1P09341 107 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-2P60368 255 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOHQ15669 191 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 OCC1Q8TAD7 63 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 HERC2O95714 4834 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPQ1 181 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 C9JQL5 133 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX46H3BTG2 121 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE6DO43924 150 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLC6P0CF74 106 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MED14OSP0DP75 135 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 MALP21145 153 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TIRAPP58753 221 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 COTL1Q14019 142 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT11Q96G61 164 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 TPPP3Q9BW30 176 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA1P01562 189 aa4.71□□□□□ -1.66
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