RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.92□□□□□ -0.18
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LIMS1-208ENST00000428064 SFRP2Q96HF1 295 aa13.92□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.92□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 Q9UF83 564 aa13.92□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 COX11Q9Y6N1 276 aa13.92□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 M0R036 132 aa13.91□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC5O15511 151 aa13.91□□□□□ -0.18
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LIMS1-208ENST00000428064 HAMPP81172 84 aa13.89□□□□□ -0.19
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.88□□□□□ -0.19
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LIMS1-208ENST00000428064 ZFP82Q8N141 532 aa13.88□□□□□ -0.19
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LIMS1-208ENST00000428064 CST9LP1Q5W188 147 aa13.86□□□□□ -0.19
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LIMS1-208ENST00000428064 AKR1C3P42330 323 aa13.85□□□□□ -0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF345Q14585 488 aa13.85□□□□□ -0.19
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LIMS1-208ENST00000428064 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 UMAD1C9J7I0 102 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2D3P61077 147 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2D2P62837 147 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ELOBQ15370 118 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.83□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 LECT2O14960 151 aa13.82□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PAGE4O60829 102 aa13.82□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.82□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.82□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WX48 190 aa13.81□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N976 141 aa13.81□□□□□ -0.2
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LIMS1-208ENST00000428064 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
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LIMS1-208ENST00000428064 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.79□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 HMSDA8MTL9 139 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PFDN1O60925 122 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 Q0VG73 95 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PRR27Q6MZM9 219 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.78□□□□□ -0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.77□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.77□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AL1P0C617 328 aa13.77□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.77□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2WQ96B02 151 aa13.77□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 BAGE2Q86Y30 109 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0D9SG52 128 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF56Q15929 161 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GV50 99 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L11O43521 198 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 PKIAP61925 76 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf177Q52M58 125 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SCXQ7RTU7 201 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 VAX2Q9UIW0 290 aa13.72□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM262E9PQX1 116 aa13.71□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01620Q4KN68 170 aa13.71□□□□□ -0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ENHOQ6UWT2 76 aa13.71□□□□□ -0.21
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