RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426722.5

NELFE-203, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-203ENST00000426722 H3BVH4 76 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 PEX7O00628 323 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 Q0VG73 95 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SFRP2Q96HF1 295 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 A0A087WX48 190 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 C14orf177Q52M58 125 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SCXQ7RTU7 201 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 Q86TA4 180 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 MED28Q9H204 178 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 Q9UF83 564 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 KLK12Q9UKR0 248 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 FAM74A7A6NL05 159 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 CRIP1P50238 77 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 ZFP82Q8N141 532 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 UBE2WQ96B02 151 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 FMC1Q96HJ9 113 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SH2D1AO60880 128 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 OXTP01178 125 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 UBE2G2P60604 165 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 UBE2G1P62253 170 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 ZNF726P1Q15940 193 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 LINC01559Q495D7 138 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 M0R036 132 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 IGLV2-8P01709 118 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 FHITP49789 147 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 UBE2D3P61077 147 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 PKIAP61925 76 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 UBE2D2P62837 147 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 A0A087WWL8 130 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 M0R381 172 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 PTTG1O95997 202 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 LINC01620Q4KN68 170 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TMEM262E9PQX1 116 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 LTAP01374 205 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 CRPP02741 224 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 RAB4BP61018 213 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 Q5BKY6 102 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 STOML3Q8TAV4 291 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-203ENST00000426722 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 CXCL1P09341 107 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 AKR1C3P42330 323 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 MIAQ16674 131 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 ENHOQ6UWT2 76 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 PRR27Q6MZM9 219 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 ZNF56Q15929 161 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 CST9LP1Q5W188 147 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 SNAI2O43623 268 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 MPV17L2Q567V2 206 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 BATF3Q9NR55 127 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 VAX2Q9UIW0 290 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 USP17L23D6RBM5 183 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 OR5AL1P0C617 328 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-203ENST00000426722 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.34□□□□□ -1.08
NELFE-203ENST00000426722 PAGE4O60829 102 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-203ENST00000426722 HLA-DQA1P01909 254 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-203ENST00000426722 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NELFE-203ENST00000426722 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-203ENST00000426722 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.33□□□□□ -1.08
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