RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ACYP1P07311 99 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 HERV-K104P63124 156 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf38Q86SI9 138 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2BP63146 152 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 RBAKDNA6NC62 111 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0J9YXV3 536 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLL5B9A064 214 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YGX0 51 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-17P01599 117 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 A4D1N5 150 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS47A8MTI9 375 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRY2O43597 315 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01545Q5VT33 79 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0J9YY99 117 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 CTSZQ9UBR2 303 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFS5O43920 106 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 BUB3O43684 328 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 TEN1Q86WV5 123 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 BSNQ9UPA5 3926 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 GP9P14770 177 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 U3KQA8 63 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf47Q569G3 176 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 NUPR1O60356 82 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 LHBP01229 141 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 Q9HAA7 133 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV4-59P01825 116 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01620Q4KN68 170 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZQT7 251 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 K7EIM0 57 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRG1Q3Y452 100 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL24O00175 119 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 ATOX1O00244 68 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 FXYD2P54710 66 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 WFDC2Q14508 124 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GX51 115 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 PATE2Q6UY27 113 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF152Q8N8N0 203 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 I3L2K1 104 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV2-23P01705 113 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 PRB1P04280 392 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 CTSGP08311 255 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB136Q30KP8 78 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 AJUBAQ96IF1 538 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7A2LO14548 114 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 HIGD1BQ9P298 99 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0B4J2C4 111 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 GYPEP15421 78 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 PIFOQ8TCI5 191 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7B2Q8TF08 81 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-202ENST00000426333 MP68P56378 58 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1503 ms