RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTH2Q96A98 100 aa8.69□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPV4 95 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8W036 122 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCGP01275 180 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00694P0DN24 101 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCXQ7RTU7 201 aa8.68□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GV50 99 aa8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC11CQ9BY50 192 aa8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE12JA6NER3 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGTLC3B5MD39 225 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCO1O75880 301 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRAP04437 139 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE1Q13065 139 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE4Q13068 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE5Q13069 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01620Q4KN68 170 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAGE13Q4V321 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAALCQ8WXS3 180 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARLQ9H300 379 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX11Q9Y6N1 276 aa8.66□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EQM0 130 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMUG1Q53HV7 270 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVBPQ8N300 66 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT8Q8NBV8 401 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSG8Q9UQ74 426 aa8.65□□□□□ -1.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MWV9 139 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCYAP1P18509 176 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL20P78556 96 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMI2Q96E14 147 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WWC5 75 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9JQL5 133 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV2-11P01706 119 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAG3L2P0CL84 134 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAG3L3P0CL85 134 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF726P1Q15940 193 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00479Q96M42 142 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.64□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAPINO95295 136 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNA1P01562 189 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRNTQ86SH4 94 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N976 141 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUN5Q8TC36 379 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9UF83 564 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.63□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNG13Q9P2W3 67 aa8.62□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXTP01178 125 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCHFRP30047 84 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIT1Q86X76 327 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JPT2Q9H910 190 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPDR1Q9UM22 224 aa8.61□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL2P10415 239 aa8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASIPP42127 132 aa8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB24Q969Q5 203 aa8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK12Q9UKR0 248 aa8.6□□□□□ -1.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHODO00212 210 aa8.59□□□□□ -1.03
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