RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 RS1O15537 224 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 JPT2Q9H910 190 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0J9YWU9 116 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHODO00212 210 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYGDP07320 174 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB130BP0DP73 79 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB130AP0DP74 79 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4C5Q8NGB2 326 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087WWL8 130 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS10P46783 165 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAD1P61803 113 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 CELA1Q9UNI1 258 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 APCSP02743 223 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMN1Q8IY45 258 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRZBQ92765 325 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB4AP20338 218 aa12.04□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00315P59091 139 aa12.04□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.03□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGPP08493 103 aa12.03□□□□□ -0.48
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF185Q96GF1 192 aa12.03□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF479Q96JC4 524 aa12.03□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRAP2Q96G30 205 aa12.02□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 F5H697 171 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPBPP02775 128 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5G1P05496 136 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF56Q15929 161 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.01□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-53P01767 116 aa12□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRGC2P03986 189 aa12□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDA2RQ9HAV5 297 aa12□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.99□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7C1H1 209 aa11.99□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf74Q32Q52 190 aa11.99□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 U3KQK5 164 aa11.99□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CKS2P33552 79 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 FHL2Q14192 279 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORMDL3Q8N138 153 aa11.98□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R17O96001 155 aa11.97□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.97□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC4Q99102 2169 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 D6R8Y8 96 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QY20 66 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHOX2AO14813 284 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.96□□□□□ -0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZSN1 163 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZTC4 211 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRELID3AQ96N28 172 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO0255Q9UI72 69 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.95□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EQD1 137 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCR2O95944 276 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXA5P20719 270 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 F5H768 121 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMKR1H3BMG3 65 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRIP30626 198 aa11.93□□□□□ -0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 NIT2Q9NQR4 276 aa11.93□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF6BO95407 300 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 HTN3P15516 51 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYBA4P53673 196 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRACQ8N912 160 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAS8-AS1O95177 125 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf78Q9BR46 151 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPYP01303 97 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAX4O43316 350 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 P0DMU3 169 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM231AP0DMU4 169 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM231CP0DMU5 169 aa11.9□□□□□ -0.5
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