RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 A0A087WWL8 130 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 HMSDA8MTL9 139 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 SH2D1AO60880 128 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 CRIP1P50238 77 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 TOR2AQ5JU69 321 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 KLK12Q9UKR0 248 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 A0A087WWC5 75 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 FAM74A7A6NL05 159 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 ZNF345Q14585 488 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 SCXQ7RTU7 201 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 NIT1Q86X76 327 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 SYT8Q8NBV8 401 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 COX11Q9Y6N1 276 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 M0R381 172 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 RHODO00212 210 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 Q6ZNX1 250 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 UBE2WQ96B02 151 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 A0A0D9SG52 128 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 DNLZQ5SXM8 178 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 RMI2Q96E14 147 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 SFRP2Q96HF1 295 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 SEC11BP0C7V7 166 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 UBE2G1P62253 170 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 Q8N976 141 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 A0A087WX48 190 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 FMC1Q96HJ9 113 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-207ENST00000420709 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 BCL2L11O43521 198 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 UBE2D3P61077 147 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 UBE2D2P62837 147 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 LINC01559Q495D7 138 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 CST9LP1Q5W188 147 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ZFP82Q8N141 532 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TMEM262E9PQX1 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 PFDN1O60925 122 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 LTAP01374 205 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 AKR1C3P42330 323 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TMUB2Q71RG4 321 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 FHITP49789 147 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ELOBQ15370 118 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ZNF56Q15929 161 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 UMAD1C9J7I0 102 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 MPV17L2Q567V2 206 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ENHOQ6UWT2 76 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 STOML3Q8TAV4 291 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 A0A1B0GV50 99 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 PAGE4O60829 102 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 IGLV2-8P01709 118 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 CRPP02741 224 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-207ENST00000420709 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms