RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ODF3BA8MYP8 253 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EP13 123 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV12-3P01733 135 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EQD1 137 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MRAPQ8TCY5 172 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PRORYQ9H606 182 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NACAE9PAV3 2078 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf84I3L1E1 186 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01545Q5VT33 79 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BMG7 143 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 GYPEP15421 78 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF503Q96F45 646 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CTRLP40313 264 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf38Q86SI9 138 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 AMTNQ6UX39 209 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0J9YXV3 536 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV25A0A0B4J276 109 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM126AQ9H061 195 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD39Q53RE8 183 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP5G1P05496 136 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 SPART-AS1P0CW21 52 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 C4orf3Q8WVX3 66 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MED14OSP0DP75 135 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MYCNOSP40205 109 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD19Q96LW7 228 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CFC1BP0CG36 223 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CFC1P0CG37 223 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.39■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CRLF1O75462 422 aa16.39■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM61Q8N0U2 210 aa16.39■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC140Q96MF4 163 aa16.39■□□□□ 0.22
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01548A6NM66 108 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 HERV-K104P63124 156 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 TDRG1Q3Y452 100 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0J9YX75 114 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 FSTL3O95633 263 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 Q9HAA7 133 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC168Q8NDH2 2452 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 IGF2RP11717 2491 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS47A8MTI9 375 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 EP400Q96L91 3159 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G5P39877 138 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB125Q8N687 156 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 UBL5Q9BZL1 73 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 ALPK3Q96L96 1907 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 ESM1Q9NQ30 184 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZVH6 145 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHG4P01861 327 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRJ-201ENST00000418331 MDFICQ9P1T7 246 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 C10orf142B7Z368 130 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 IFITM1P13164 125 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL25O15444 150 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 HAMPP81172 84 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TOMM6Q96B49 74 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 IGF1P05019 195 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TIMM17AQ99595 171 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 BAALCQ8WXS3 180 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DSCR8Q96T75 97 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV2-8P01709 118 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB135Q30KP9 77 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms