RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A0J9YX75 114 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 C11orf86A6NJI1 115 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF815PA8K554 130 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 H3BVH4 76 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 NDUFA4O00483 81 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV1-69P01742 117 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRGV3P03979 118 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CD7P09564 240 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 COX6B1P14854 86 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRTAP5-9P26371 169 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 HLA-DMBP28068 263 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CRYBA4P53673 196 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 FXYD7P58549 80 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CKS1BP61024 79 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP5G2Q06055 141 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 WFDC2Q14508 124 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PMVKQ15126 192 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 RHOHQ15669 191 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLEC2AQ6UVW9 174 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 BAALCQ8WXS3 180 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 RASL10AQ92737 203 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 USMG5Q96IX5 58 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ODF3Q96PU9 254 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 KIR2DL4Q99706 377 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACACAQ13085 2346 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A0B4J2C4 111 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 A8MWV9 139 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 VCYO14598 125 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSPAN13O95857 204 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 P0DMU3 169 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM231AP0DMU4 169 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM231CP0DMU5 169 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 EFNA4P52798 201 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q6ZUT4 128 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 NFE4Q86UQ8 179 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM219Q86XT9 240 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF182Q8N6D2 247 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 DUX3Q96PT4 197 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIRPDQ9H106 197 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 S4R3C0 116 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 APC2O95996 2303 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 CACNA1BQ00975 2339 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A0J9YY99 117 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGIPA6NJ69 53 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 KLLNB2CW77 178 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 LGALS9O00182 355 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SOCS3O14543 225 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 LEPROTO15243 131 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP6V0E1O15342 81 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV3-23P01764 117 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV3-30P01768 117 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGF1P05019 195 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPINK8P0C7L1 97 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF688P0C7X2 276 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARL3P36405 182 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ID1P41134 155 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ECSCRQ19T08 205 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF876PQ49A33 203 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q6Q795 121 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms