RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ODF3Q96PU9 254 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 VCX2Q9H322 139 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A096LNJ9 63 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 AMTNQ6UX39 209 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF747Q9BV97 191 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf95Q9H693 158 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 JPT2Q9H910 190 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MDFICQ9P1T7 246 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf202A1L168 122 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 INAFM1C9JVW0 142 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BMM0 161 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HBDP02042 147 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C20orf144Q9BQM9 153 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf43Q9BWL3 253 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM160Q9NX00 188 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WWL8 130 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf118A6NHY6 69 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM17P0DL12 118 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DRB4P13762 266 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FHL3Q13643 280 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NRACQ8N912 160 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C18orf15Q96N68 181 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1S3Q96PC3 154 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 JMJD8Q96S16 334 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.94□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC4Q99102 2169 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 F5H697 171 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TCAPO15273 167 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 PRM2P04554 102 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N8P6 123 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MRAP2Q96G30 205 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 hDV102S1A0JD36 115 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SAP30O75446 220 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLL1P15814 213 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FCER1GP30273 86 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 PROK1P58294 105 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 RASL10AQ92737 203 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.93□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 OR11H12B2RN74 326 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SIVA1O15304 175 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NXPH4O95158 308 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA7O95182 113 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLC3P0DOY3 106 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LAGE3Q14657 143 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF876PQ49A33 203 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LCE1DQ5T752 114 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01545Q5VT33 79 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 STHQ8IWL8 128 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT8Q8NBV8 401 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf85Q96MD7 179 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 XCL2Q9UBD3 114 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 JMJD1CQ15652 2540 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 HIVEP1P15822 2718 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BS24 57 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT3O95989 172 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS1P07477 247 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00315P59091 139 aa2.92□□□□□ -1.94
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZN92 141 aa2.92□□□□□ -1.94
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