RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 MSMO1Q15800 293 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 GUK1Q16774 197 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 FAM78BQ5VT40 261 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZS49 121 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 AMN1Q8IY45 258 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 H3BMM0 161 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PSCAO43653 123 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 FABP1P07148 127 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TGFBR1P36897 503 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LPAR6P43657 344 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PSG9Q00887 426 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 KLK9Q2XQG4 91 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 MED28Q9H204 178 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 C8orf4Q9NR00 106 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 RPRMQ9NS64 109 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF492Q9P255 531 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 RAB26Q9ULW5 256 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 IFITM5A6NNB3 132 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 I3L2K1 104 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PRCDQ00LT1 54 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DCANP1Q8TF63 244 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 KMT2AQ03164 3969 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DISC1C4P0D8 188 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 GABARAPH6UMI1 98 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 GPR31O00270 319 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 OR5G3P0C626 314 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A4P12235 298 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 CRYBB3P26998 211 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 RHOBP62745 196 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 HERVK_113P63121 156 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SPINK9Q5DT21 86 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 Q8N9L7 120 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 A0A0J9YY99 117 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GV50 99 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 OR10J1P30954 320 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LINC00315P59091 139 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TAS2R20P59543 309 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 LINC00483Q53H64 154 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 OR4X1Q8NH49 305 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 DOK5Q9P104 306 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 C7orf66A4D0T2 115 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ZNF98A6NK75 572 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 EVI2AP22794 236 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 IFITM2Q01629 132 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 S100A7AQ86SG5 101 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 MGLLQ99685 303 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-201ENST00000358813 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms