RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.15
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SH3BP1-201ENST00000357436 CEND1Q8N111 149 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SH3BP1-201ENST00000357436 COTL1Q14019 142 aa14.08□□□□□ -0.16
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SH3BP1-201ENST00000357436 CSTL1Q9H114 145 aa14.05□□□□□ -0.16
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SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf74Q32Q52 190 aa13.98□□□□□ -0.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 HIST1H4GQ99525 98 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR11H12B2RN74 326 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV3-20P01619 116 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPPLY3P57055 190 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR11H1Q8NG94 326 aa13.96□□□□□ -0.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CD7P09564 240 aa13.94□□□□□ -0.18
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SH3BP1-201ENST00000357436 SLURP1P55000 103 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PRX2 142 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
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SH3BP1-201ENST00000357436 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WWL8 130 aa13.91□□□□□ -0.18
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SH3BP1-201ENST00000357436 K7EQG2 157 aa13.91□□□□□ -0.18
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