RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 UQCC3Q6UW78 93 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 VCX2Q9H322 139 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 COX11Q9Y6N1 276 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 F2Z2F3 143 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5LO75964 103 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FABP4P15090 132 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PCP4P48539 62 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf177Q52M58 125 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PATE2Q6UY27 113 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SVIPQ8NHG7 77 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MDFICQ9P1T7 246 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM218A2RU14 115 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SNCGO76070 127 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE2BQ13066 116 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MORN5Q5VZ52 161 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IL36BQ9NZH7 164 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 DKK2Q9UBU2 259 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV2-8P01709 118 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AL1P0C617 328 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 XCL1P47992 114 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TCTAP57738 103 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CASC10Q5T4H9 136 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NAT8Q9UHE5 227 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IFITM10A6NMD0 228 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PDZD2O15018 2839 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RRA0 63 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS47A8MTI9 375 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CRISP2P16562 243 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RNF212Q495C1 297 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF479Q96JC4 524 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM229AH3BQW9 127 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SNAPINO95295 136 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 KIR3DS1Q14943 382 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SVBPQ8N300 66 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PARLQ9H300 379 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf202A1L168 122 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 K7EQD1 137 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PLP1P60201 277 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf33Q8WU49 177 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf173Q96LM9 149 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SEC11CQ9BY50 192 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM74A7A6NL05 159 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RAB5BP61020 215 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf74Q32Q52 190 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RASL11AQ6T310 242 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 DCANP1Q8TF63 244 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 VPS13CQ709C8 3753 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NF1P21359 2839 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C9JQL5 133 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf223Q8N319 242 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 HIGD1CA8MV81 97 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00587B1AMM8 73 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF253O75346 499 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NCR2O95944 276 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FXYD5Q96DB9 178 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF503Q96F45 646 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.2 ms