RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 NACAE9PAV3 2078 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1B0GUT8 65 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 PAX4O43316 350 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 HOXA5P20719 270 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 RIGQ13278 110 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 FHL2Q14192 279 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 RHEBQ15382 184 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 SVBPQ8N300 66 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM1-201ENST00000328020 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 A0A087WWL8 130 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 A0A0J9YY99 117 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1B0GW15 77 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SNAPINO95295 136 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 APOC3P02656 99 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 S100A8P05109 93 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 CRYBA4P53673 196 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 RHOHQ15669 191 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 NUP35Q8NFH5 326 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 JPT2Q9H910 190 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 F5H697 171 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 NUDT3O95989 172 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 CRYGDP07320 174 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 RAB4BP61018 213 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF56Q15929 161 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 IMMP2LQ96T52 175 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 H7C1H1 209 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 S100PP25815 95 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 A0A087WWC5 75 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 K7EQD1 137 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 APLNQ9ULZ1 77 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 MGPP08493 103 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 GYPEP15421 78 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 EVI2AP22794 236 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SRIP30626 198 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.85□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 P0DMU3 169 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 FAM231AP0DMU4 169 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 FAM231CP0DMU5 169 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 HBBP68871 147 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 FRZBQ92765 325 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 BTF3L4Q96K17 158 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 CCL18P55774 89 aa9.83□□□□□ -0.84
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CMTM1-201ENST00000328020 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 A0A096LPF7 62 aa9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 CAMPP49913 170 aa9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.82□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 LINC00315P59091 139 aa9.81□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 Q6ZSN1 163 aa9.81□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 RASL11AQ6T310 242 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 GAGE12JA6NER3 117 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 PPP1R17O96001 155 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 GAGE1Q13065 139 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 GAGE4Q13068 117 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 GAGE5Q13069 117 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 GAGE13Q4V321 117 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 MRAP2Q96G30 205 aa9.79□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1B0GXF2 115 aa9.78□□□□□ -0.84
CMTM1-201ENST00000328020 M0QY20 66 aa9.78□□□□□ -0.84
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