RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 PRNTQ86SH4 94 aa10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 IGLV2-11P01706 119 aa10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 OSTCQ9NRP0 149 aa10.13□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FAM223BA6NKX1 122 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 BUB3O43684 328 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FSHBP01225 129 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 LTAP01374 205 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 DUX3Q96PT4 197 aa10.12□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CACNG7P62955 275 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 C12orf74Q32Q52 190 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 TEN1Q86WV5 123 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FMC1Q96HJ9 113 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 MLST8Q9BVC4 326 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 Q86TA4 180 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 GATD1Q8NB37 220 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 AKAP9Q99996 3911 aa10.11□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 RRN3P1Q2M238 152 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 ATP5LO75964 103 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 IGLV1-40P01703 118 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 Q6YL49 198 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 NUP35Q8NFH5 326 aa10.1□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF785A8K8V0 405 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 PDE6HQ13956 83 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 RNF182Q8N6D2 247 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 METTL26Q96S19 204 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CFHR3Q02985 330 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 AGRNO00468 2067 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 NDUFA7O95182 113 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 CEND1Q8N111 149 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.09□□□□□ -0.79
C9orf106-201ENST00000316786 IGHG4P01861 327 aa10.08□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ORM1P02763 201 aa10.08□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF747Q9BV97 191 aa10.08□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 MDFICQ9P1T7 246 aa10.08□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 HIGD1CA8MV81 97 aa10.08□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 A8MWV9 139 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 Q8TAT8 98 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 USMG5Q96IX5 58 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 V9GYY9 64 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 C8orf49Q96NF6 230 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 HIST1H4GQ99525 98 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 FXYD7P58549 80 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF415Q09FC8 603 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.07□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PRX2 142 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 H3BUA1 57 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 PF4P02776 101 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 PSMB8P28062 276 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 PRAC2D3DTV9 90 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 P01737 135 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM160Q9NX00 188 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF702PQ9H963 129 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 RS1O15537 224 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 CRIP1P50238 77 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 U3KQE9 123 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 NDUFA4O00483 81 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ERCC8Q13216 396 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 CD7P09564 240 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 HBBP68871 147 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
C9orf106-201ENST00000316786 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms