RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 RASL10AQ92737 203 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0J9YXV3 536 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TCL1BO95988 128 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC140Q96MF4 163 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 Q8NA96 180 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 RNF183Q96D59 192 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 RBAKDNA6NC62 111 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MOB4Q9Y3A3 225 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM262E9PQX1 116 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ATP5J2P56134 94 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 DUX3Q96PT4 197 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 DAND5Q8N907 189 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 NRACQ8N912 160 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 LAMA5O15230 3695 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PIEZO1Q92508 2521 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 BLCAPP62952 87 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 C20orf173Q96LM9 149 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 LRBAP50851 2863 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 F8W735 103 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 Q6ZS46 218 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 HIVEP2P31629 2446 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 M0R2P5 195 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 ZZEF1O43149 2961 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TEN1Q86WV5 123 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 LY6LH3BQJ8 138 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2E1P51965 193 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 KLRB1Q12918 225 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 OOSP1A8MZH6 123 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TOMM6Q96B49 74 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TIMM21Q9BVV7 248 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 ABCA12Q86UK0 2595 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 RS1O15537 224 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 SYNJ2BPP57105 145 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 Q6ZUT4 128 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 AKAP13Q12802 2813 aa11□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CFC1BP0CG36 223 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CFC1P0CG37 223 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV3-53P01767 116 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 IGHG4P01861 327 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 XGP55808 180 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 MTORP42345 2549 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 ATXN8Q156A1 80 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 LRRK2Q5S007 2527 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CDSNQ15517 529 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 LINC01587Q99440 93 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 MDFICQ9P1T7 246 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRN-201ENST00000295718 P0DMU3 169 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 FAM231AP0DMU4 169 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 FAM231CP0DMU5 169 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 SCGB1A1P11684 91 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 PRO3102Q9H379 93 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 NFE4Q86UQ8 179 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0J9YY99 117 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 H3BMM0 161 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2WQ96B02 151 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 A8MZ25 164 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC2BQ92478 149 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 PRM2P04554 102 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 AJUBAQ96IF1 538 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-201ENST00000295718 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms