RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 VPS25Q9BRG1 176 aa7.77□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.77□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 FABP2P12104 132 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 PLNP26678 52 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 MBD6Q96DN6 1003 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0J9YY99 117 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 MALP21145 153 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 DMDP11532 3685 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 K7EQG2 157 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 RHODO00212 210 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 PRR9Q5T870 116 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 TDRG1Q3Y452 100 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ESM1Q9NQ30 184 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 IGLL1P15814 213 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 PRM2P04554 102 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 GAGE6Q13070 117 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GXF2 115 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 MPV17L2Q567V2 206 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 A0A087WX48 190 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 NACAE9PAV3 2078 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 H3BUT2 72 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 EREGO14944 169 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 CRLF1O75462 422 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 FOSL1P15407 271 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF747Q9BV97 191 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 HLA-DRB4P13762 266 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 C20orf78Q9BR46 151 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB135Q30KP9 77 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 P0DMU3 169 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 FAM231AP0DMU4 169 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 FAM231CP0DMU5 169 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 CRPP02741 224 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 PMVKQ15126 192 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 CFAP161Q6P656 301 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 H3BMM0 161 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 IGLC6P0CF74 106 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 HILS1P60008 231 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 GATD1Q8NB37 220 aa7.73□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 POLQO75417 2590 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 C16orf74Q96GX8 76 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM141Q96I45 108 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ESDP10768 282 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 DCANP1Q8TF63 244 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.72□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01549A6NIU2 74 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 SNCGO76070 127 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 IGLC3P0DOY3 106 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.71□□□□□ -1.17
TTPAL-201ENST00000262605 HSD52Q0P140 79 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.71□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM243Q9BU79 118 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 PAX4O43316 350 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 K7EQD1 137 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 SPINK8P0C7L1 97 aa7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00158P58513 81 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 RNF152Q8N8N0 203 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 J3QR89 54 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 CIDEAO60543 219 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 GAS8-AS1O95177 125 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 PROK1P58294 105 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.69□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-201ENST00000262605 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms