RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 PPP1R17O96001 155 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 CDIP1Q9H305 208 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 SUMO4Q6EEV6 95 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2D3P61077 147 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2D2P62837 147 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 CKS1BP61024 79 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 PMVKQ15126 192 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 TCL1BO95988 128 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 BLCAPP62952 87 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 UCNP55089 124 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 HERVK_113P61574 105 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 FAM74A4Q5TZK3 123 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 ZNRF2Q8NHG8 242 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 USMG5Q96IX5 58 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 POM121L12Q8N7R1 296 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV4-39P01824 125 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 CFC1BP0CG36 223 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 CFC1P0CG37 223 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 FAM159AQ6UWV7 190 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 NXPH4O95158 308 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 SORL1Q92673 2214 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 H3BUX3 64 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf84I3L1E1 186 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 CARD19Q96LW7 228 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 A0A087WW49 117 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 SDHAF1A6NFY7 115 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHG2P01859 326 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 MT-ATP8P03928 68 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV3-30P01768 117 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 KIR2DL4Q99706 377 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 KLLNB2CW77 178 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 SPINK8P0C7L1 97 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 VCYO14598 125 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 XGP55808 180 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 LY6DQ14210 128 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A29Q8N8R3 303 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 Q5PR19 223 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 IGKV3-20P01619 116 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 SCGB1C2P0DMR2 95 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 CLUHP3Q96NS8 147 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 AMELXQ99217 191 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 H3BUA1 57 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 J3QQQ9 107 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 RAX2Q96IS3 184 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 SPG11Q96JI7 2443 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 RPL32P62910 135 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 TEN1Q86WV5 123 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 C10orf126Q8N4M7 172 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 CELSR2Q9HCU4 2923 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF876PQ49A33 203 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM141Q96I45 108 aa20.14■□□□□ 0.82
FAM149A-201ENST00000227065 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 A6NDX4 124 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 Q6ZUT4 128 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 PPDPFLQ8WWR9 84 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TIMM17AQ99595 171 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 H7C2G1 150 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 BRI3O95415 125 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 LYRM7Q5U5X0 104 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 DCANP1Q8TF63 244 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 PRO1854Q9UHT4 67 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 CRYBA4P53673 196 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 MDFICQ9P1T7 246 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 IGLV1-40P01703 118 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 ID1P41134 155 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF56Q15929 161 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 ANKRD29Q8N6D5 301 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 A4D1N5 150 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 A8MWV9 139 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM95Q3KNT9 176 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF688P0C7X2 276 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF580Q9UK33 172 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa20.08■□□□□ 0.8
FAM149A-201ENST00000227065 LGALS9O00182 355 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.7 ms