RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630572.2

ZEB2-231, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, human

TSL 5

Gene ZEB2, Length 468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB2-231	ENST00000630572	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572	BATF	Q16520	125 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572		U3KQK5	164 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZEB2-231	ENST00000630572		M0R3E3	92 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	IGLL1	P15814	213 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	G0S2	P27469	103 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	TFPI2	P48307	235 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ASCL2	Q99929	193 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	COX11	Q9Y6N1	276 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SIVA1	O15304	175 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SEC11A	P67812	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	UBE2V1	Q13404	147 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SORL1	Q92673	2214 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572		A0A0J9YX75	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	HBD	P02042	147 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	DEFB131A	P59861	70 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	PRR25	Q96S07	402 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572		A8MTW9	85 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	COX8A	P10176	69 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZEB2-231	ENST00000630572	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		A6NDN8	102 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	SH2D1A	O60880	128 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	ZNF138	P52744	262 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	STPG4	Q8N801	248 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		K7EMI3	77 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	IGLC6	P0CF74	106 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	CACNG7	P62955	275 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	VGLL1	Q99990	258 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	VWF	P04275	2813 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		H3BMM0	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	CKS2	P33552	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		K7EP13	123 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	ATP5L	O75964	103 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	CD7	P09564	240 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		D6R8Y8	96 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572		F6UB75	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	PPP1R17	O96001	155 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	NPS	P0C0P6	89 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	LEP	P41159	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZEB2-231	ENST00000630572	ERCC8	Q13216	396 aa		10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms