RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM262E9PQX1 116 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB3O43676 98 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2D3P61077 147 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2D2P62837 147 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZS46 218 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N1Y9 231 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ELANEP08246 267 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 DTX2Q86UW9 622 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 RASL10AQ92737 203 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NGBQ9NPG2 151 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 ODF3Q96PU9 254 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 SHISA9B4DS77 424 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 PLGLAQ15195 96 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-211ENST00000618610 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 OOSP1A8MZH6 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 COX7A1P24310 79 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 GATA4P43694 442 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2D1P51668 147 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 NACAE9PAV3 2078 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CFC1BP0CG36 223 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CFC1P0CG37 223 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ERCC8Q13216 396 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF56Q15929 161 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PRR25Q96S07 402 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 C17orf100A8MU93 164 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CD7P09564 240 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 Q1RN00 199 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 GFRALQ6UXV0 394 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 BSPH1Q075Z2 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LAGE3Q14657 143 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N8P6 123 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 F8VRH5 84 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 DUX3Q96PT4 197 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 VCX2Q9H322 139 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 H7C1H1 209 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-23P01764 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ADIPOQQ15848 244 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01587Q99440 93 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0G2JNJ9 132 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1-17P01599 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV2-23P01705 113 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PLNP26678 52 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZS92 163 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF575Q86XF7 245 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 Q9UFV3 132 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ITPR3Q14573 2671 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 NRGNQ92686 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM178BH3BS89 294 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CCL21O00585 134 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGLC6P0CF74 106 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM4O75871 244 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 CFHR4Q92496 578 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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