RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601869.1

STRN4-222, Transcript of striatin 4, human

Gene STRN4, Length 2,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRN4-222	ENST00000601869	CRYGD	P07320	174 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869		P0DMU3	169 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	FAM231A	P0DMU4	169 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	FAM231C	P0DMU5	169 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	C15orf32	Q32M92	178 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	SFTA2	Q6UW10	78 aa		14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		14.83	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		14.83	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		14.83	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	SNCG	O76070	127 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GATA3	P23771	443 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	LINC00477	Q96M19	166 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TIMM17A	Q99595	171 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE2B	Q13066	116 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE2E	Q4V326	116 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869		U3KQE9	123 aa		14.82	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869		A0A0B4J2C4	111 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	CD3E	P07766	207 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		14.81	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	IGIP	A6NJ69	53 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	LYNX1	P0DP58	116 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	AJUBA	Q96IF1	538 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	PRR9	Q5T870	116 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	KIR2DL4	Q99706	377 aa		14.8	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869		A0A087WW49	117 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	LINC01548	A6NM66	108 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	MGP	P08493	103 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.79	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	NXPH4	O95158	308 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GPHB5	Q86YW7	130 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869		C9JAW5	83 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TSHB	P01222	138 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	C16orf92	Q96LL3	132 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		14.78	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE12J	A6NER3	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	OVOL1	O14753	267 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE7	O76087	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV3-33	P01772	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE12F	P0CL80	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE12G	P0CL81	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE12I	P0CL82	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	GAGE4	Q13068	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869		Q6ZS46	218 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	CCDC140	Q96MF4	163 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	AMELX	Q99217	191 aa		14.77	□□□□□ -0.04
STRN4-222	ENST00000601869	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		J3QQQ9	107 aa		14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	ATXN8	Q156A1	80 aa		14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		Q8N9W7	124 aa		14.77	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		B5MCH6	92 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	ROS1	P08922	2347 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	IFITM1	P13164	125 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	ZNF876P	Q49A33	203 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		Q6ZQT7	251 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	TTC32	Q5I0X7	151 aa		14.75	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		14.75	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	ZZEF1	O43149	2961 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	VCY	O14598	125 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	LEPROT	O15243	131 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		14.74	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		A0A0J9YX75	114 aa		14.73	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
STRN4-222	ENST00000601869		A4D1N5	150 aa		14.73	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms