RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 XKRY2A2RUG3 117 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 CDK2AP2O75956 126 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 GCGP01275 180 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 S100A8P05109 93 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 HTN1P15515 57 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF415Q09FC8 603 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 AGRNO00468 2067 aa5.62□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 LYRM9A8MSI8 78 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV2-11P01706 119 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 CENPWQ5EE01 88 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 SFRP2Q96HF1 295 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 SGK494Q96LW2 274 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 DERL1Q9BUN8 251 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 NAGKQ9UJ70 344 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RNF213Q63HN8 5207 aa5.61□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RTL8CO15255 209 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ORM1P02763 201 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 TYMSP04818 313 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 S100A6P06703 90 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 TDRG1Q3Y452 100 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 Q8NAQ8 132 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 FAM210BQ96KR6 192 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00479Q96M42 142 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 SPXQ9BT56 116 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 X6R8D5 127 aa5.6□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0J9YWU9 116 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 CXCL1P09341 107 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 ASIPP42127 132 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 EMP1P54849 157 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 OR5I1Q13606 314 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf49Q96NF6 230 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.59□□□□□ -1.51
ZNF548-208ENST00000597576 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 SH2D1AO60880 128 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 P01737 135 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM6P0DI80 62 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 AKR1D1P51857 326 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 DAD1P61803 113 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 CTAG1AP78358 180 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 MUC21Q5SSG8 566 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 PRR27Q6MZM9 219 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 SYT8Q8NBV8 401 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 OCC1Q8TAD7 63 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 MLST8Q9BVC4 326 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 OSTCQ9NRP0 149 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 IL36BQ9NZH7 164 aa5.58□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PPQ1 181 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf52A6NGY3 159 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 K7EN84 100 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 CIDEAO60543 219 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 TCL1AP56279 114 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 KIR3DS1Q14943 382 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01559Q495D7 138 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 COX19Q49B96 90 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 PRR9Q5T870 116 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 C12orf57Q99622 126 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 DKK2Q9UBU2 259 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 M0R2P5 195 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV2-8P01709 118 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 ERVFC1-1P60608 527 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 CT83Q5H943 113 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.56□□□□□ -1.52
ZNF548-208ENST00000597576 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms