RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 GNRH2O43555 120 aa10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 LY6G6DO95868 133 aa10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 FHL3Q13643 280 aa10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TCF21O43680 179 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TSPOP30536 169 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CCL24O00175 119 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CDKN1BP46527 198 aa10.26□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 M0R381 172 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 JMJD8Q96S16 334 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 VAMP8Q9BV40 100 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 PCP4P48539 62 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.25□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 NDUFA7O95182 113 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB131AP59861 70 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TNFRSF6BO95407 300 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.24□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 GAS8-AS1O95177 125 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 AMTNQ6UX39 209 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 AGRNO00468 2067 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 KNCNA6PVL3 124 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 SPRY2O43597 315 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CD7P09564 240 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 HLA-DRB4P13762 266 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 GAGE1Q13065 139 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.23□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 OR4C46A6NHA9 309 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZVH6 145 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 MRAP2Q96G30 205 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 NF1P21359 2839 aa10.22□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.21□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 NXPH4O95158 308 aa10.21□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.21□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
FCHO1-221ENST00000597512 A8MTW9 85 aa10.21□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 AP1S3Q96PC3 154 aa10.21□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 A0A096LNJ9 63 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 LINC01546A6NGU7 62 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 H3BMM0 161 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 STPG4Q8N801 248 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 NRACQ8N912 160 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 HIVEP2P31629 2446 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 C20orf202A1L168 122 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 HBDP02042 147 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 PROK1P58294 105 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 ATOH7Q8N100 152 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF747Q9BV97 191 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 MUC4Q99102 2169 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 PET117Q6UWS5 81 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 MTORP42345 2549 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 SORL1Q92673 2214 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 PRSS47A8MTI9 375 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 FXYD7P58549 80 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 SPATA45Q537H7 98 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 MAJINQ3KP22 176 aa10.18□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 Q8N1Y9 231 aa10.18□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB125Q8N687 156 aa10.18□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 Q8N8P6 123 aa10.18□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 C9orf85Q96MD7 179 aa10.18□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 INAFM1C9JVW0 142 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 MGPP08493 103 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 MDFICQ9P1T7 246 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 SMIM17P0DL12 118 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZN92 141 aa10.17□□□□□ -0.78
FCHO1-221ENST00000597512 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms