RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 H3BNG1 76 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 HTN3P15516 51 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF876PQ49A33 203 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 SYT8Q8NBV8 401 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF575Q86XF7 245 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 H3BVH4 76 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 OR5AL1P0C617 328 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 APLNQ9ULZ1 77 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 A8MWV9 139 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 LINC01551Q86U37 167 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 ZFP82Q8N141 532 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 A0A1W2PPQ1 181 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 K7EN84 100 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 SNAI2O43623 268 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 NUDT11Q96G61 164 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-212ENST00000596309 C9JQL5 133 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 F2Z2F3 143 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 RS1O15537 224 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 UQCC3Q6UW78 93 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 NAT8Q9UHE5 227 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 PRO0255Q9UI72 69 aa13.58□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 HOXA5P20719 270 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 CT83Q5H943 113 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 NXPH4O95158 308 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 ERVFC1-1P60608 527 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 FHL2Q14192 279 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 OSTCQ9NRP0 149 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 RHODO00212 210 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 IGLC6P0CF74 106 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 CACNG7P62955 275 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 WDR73Q6P4I2 378 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF479Q96JC4 524 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 LCE6AA0A183 80 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 A8MWL6 223 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 IGHV3-53P01767 116 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 P0DMU3 169 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 FAM231AP0DMU4 169 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 FAM231CP0DMU5 169 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 PAX4O43316 350 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 CRYBA4P53673 196 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 SFRP2Q96HF1 295 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-212ENST00000596309 FAM231BA6NCW3 169 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 M0R381 172 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 SFTA3P0C7M3 94 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 ISOC2Q96AB3 205 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 CNFNQ9BYD5 112 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 NACAE9PAV3 2078 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 CTRLP40313 264 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 ADIRFQ15847 76 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 RNF212Q495C1 297 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.5□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 A0A0J9YY99 117 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 LINC00862A6NCI5 91 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 NUDT3O95989 172 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 GZMBP10144 247 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 TSKUQ8WUA8 353 aa13.49□□□□□ -0.25
FCHO1-212ENST00000596309 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms