RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 HIST1H2BDP58876 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST1H2BCP62807 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 PRR27Q6MZM9 219 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 Q86TA4 180 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 LINC01587Q99440 93 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 PRAC2D3DTV9 90 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 M0R3E3 92 aa9.36□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.36□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 DEFB130BP0DP73 79 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 DEFB130AP0DP74 79 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 KIR3DS1Q14943 382 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.35□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 PKD1P98161 4303 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-210ENST00000591412 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.34□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 C16orf74Q96GX8 76 aa9.34□□□□□ -0.91
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CTIF-210ENST00000591412 COX19Q49B96 90 aa9.33□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 NACAE9PAV3 2078 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 A8MWL6 223 aa9.32□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.32□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 WDR73Q6P4I2 378 aa9.31□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.31□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 NUP35Q8NFH5 326 aa9.3□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 SNURFLB1AK76 121 aa9.29□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 FAM231BA6NCW3 169 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 HIGD1CA8MV81 97 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 NUDT3O95989 172 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 S100A8P05109 93 aa9.28□□□□□ -0.92
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CTIF-210ENST00000591412 CRIP1P50238 77 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-210ENST00000591412 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.27□□□□□ -0.93
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