RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 KLK12Q9UKR0 248 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RAB26Q9ULW5 256 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 U3KQ87 197 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0J9YY99 117 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 BPY2O14599 106 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SNAI2O43623 268 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 HTN1P15515 57 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RHOBP62745 196 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 OR2F1Q13607 317 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 INSL4Q14641 139 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZRU5 148 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 RSG1Q9BU20 258 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 WFDC1Q9HC57 220 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PRO0255Q9UI72 69 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV2-8P01709 118 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 P01737 135 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CRYGDP07320 174 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PSG3Q16557 428 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 BSXQ3C1V8 233 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZSA8 131 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZVH6 145 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N814 137 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 MGLLQ99685 303 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 A0A096LPF7 62 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 C9JCJ5 164 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 OR5AL1P0C617 328 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 OR5AC1P0C628 307 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL2P19875 107 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SRIP30626 198 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RCVRNP35243 200 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FABP5Q01469 135 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 AMTNQ6UX39 209 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LGI3Q8N145 548 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF738Q8NE65 137 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RMI2Q96E14 147 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 KCNS1Q96KK3 526 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 NACAE9PAV3 2078 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0D9SG52 128 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FABP12A6NFH5 140 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 M0R2Z0 102 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DQA1P01909 254 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 AZU1P20160 251 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 C6orf99Q4VX62 202 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 GPR146Q96CH1 333 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ACY3Q96HD9 319 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ODF3Q96PU9 254 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRGV9Q99603 122 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 COPZ2Q9P299 210 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SSR3Q9UNL2 185 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GW15 77 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.3□□□□□ -1.88
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