RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 APOMO95445 188 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 FHL3Q13643 280 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CITED1Q99966 193 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ODF3BA8MYP8 253 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 BUB3O43684 328 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 FOXI1Q12951 378 aa11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.07□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 NFE4Q86UQ8 179 aa11.07□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.07□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.07□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.07□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 AKAP6Q13023 2319 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ID1P41134 155 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 Q6ZUT4 128 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 Q8N6K4 173 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SYT8Q8NBV8 401 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 TOMM6Q96B49 74 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 KLK15Q9H2R5 256 aa11.06□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 MT-ATP8P03928 68 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 UBE2D1P51668 147 aa11.05□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 H3BVH4 76 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 PRR9Q5T870 116 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.04□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 LINC01549A6NIU2 74 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 RNF223E7ERA6 249 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 COX6B1P14854 86 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 RASL10AQ92737 203 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SCGB2A1O75556 95 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 BAALCQ8WXS3 180 aa11.03□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 LINC01548A6NM66 108 aa11.02□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 SLC25A16P16260 332 aa11.02□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 XGP55808 180 aa11.02□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 C15orf32Q32M92 178 aa11.02□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 GLMPQ8WWB7 406 aa11.02□□□□□ -0.64
ITGA3-216ENST00000570989 CD7P09564 240 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 UBE2D3P61077 147 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 UBE2D2P62837 147 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 SFTA2Q6UW10 78 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 PTH2Q96A98 100 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 CARD19Q96LW7 228 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 VCX2Q9H322 139 aa11.02□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ZNF815PA8K554 130 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 M0R1W7 72 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 SPRY2O43597 315 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 MED13LQ71F56 2210 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 B5MCH6 92 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 PRTN3P24158 256 aa11.01□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 IGF1P05019 195 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 PSMB2P49721 201 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 EBI3Q14213 229 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC140Q96MF4 163 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ATP5J2P56134 94 aa11□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 Q8N9W7 124 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 A4D1N5 150 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 CRYGDP07320 174 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 KLK9Q2XQG4 91 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.98□□□□□ -0.65
ITGA3-216ENST00000570989 M0R381 172 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms