RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MGP	P08493	103 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	CEND1	Q8N111	149 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01549	A6NIU2	74 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	GNRH2	O43555	120 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD2	P54710	66 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	DSCR9	P59020	149 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RNF151	Q2KHN1	245 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZS46	218 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19	3e-6	■■■■□ 24
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WW49	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SPRY2	O43597	315 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01619	G3V211	115 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB8	P28062	276 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VPS25	Q9BRG1	176 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SRD5A1	P18405	259 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	AVP	P01185	164 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00315	P59091	139 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H4G	Q99525	98 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FLNC	Q14315	2725 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CD7	P09564	240 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MUC4	Q99102	2169 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559		E9PLD3	99 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VCY	O14598	125 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		K7ERJ3	54 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		J3QLI3	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	EDN2	P20800	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM141	Q96I45	108 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YX75	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		F5H697	171 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS9	O00182	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	IGLL5	B9A064	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	AGRN	O00468	2067 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559		K7EQG2	157 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM17A	Q99595	171 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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