RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	PTH2	Q96A98	100 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	LINC01587	Q99440	93 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	SPX	Q9BT56	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965		B5MCH6	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	CIDEA	O60543	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	SH2D1A	O60880	128 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ORM1	P02763	201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	S100A1	P23297	94 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	CRIP1	P50238	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	DEFA6	Q01524	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	ADIRF	Q15847	76 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	PRR9	Q5T870	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1B0GW15	77 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	CBY3	A6NI87	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		M0R036	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SNAI2	O43623	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	APOC3	P02656	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TYMS	P04818	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ASIP	P42127	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TCL1A	P56279	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	CACNG7	P62955	275 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	OR5I1	Q13606	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		J3KRW8	73 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		M0R2P5	195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	S100A8	P05109	93 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	CTRL	P40313	264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FXYD7	P58549	80 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RNF212	Q495C1	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		Q6ZSN1	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		Q8NAQ8	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RASL10A	Q92737	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FRZB	Q92765	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		V9GYV3	84 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		A8MWV9	139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NXPH4	O95158	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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