RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC13O75165 2243 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.4□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 ADCY9O60503 1353 aa-0.41□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PI4KAP42356 2102 aa-0.41□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ATG12O94817 140 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A4P12235 298 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CKS2P33552 79 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ARF6P62330 175 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BLCAPP62952 87 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 INSL4Q14641 139 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 C4orf33Q8N1A6 199 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BATF3Q9NR55 127 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ARMC1Q9NVT9 282 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MED11Q9P086 117 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 V9GYV3 84 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TACC2O95359 2948 aa-0.41□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MYH3P11055 1940 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PARP14Q460N5 1801 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 K7EQZ3 153 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DEGS1O15121 323 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NPFFO15130 113 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MFSD11O43934 449 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CST2P09228 141 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ADCYAP1P18509 176 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 S100A3P33764 101 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SDC2P34741 201 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CCL7P80098 99 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OR8B8Q15620 311 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CEP19Q96LK0 163 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OTORQ9NRC9 128 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZFYVE9O95405 1425 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PKHD1P08F94 4074 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ADGBQ8N7X0 1667 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PLXNA2O75051 1894 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 H3BMG7 143 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PIN1P1O15428 100 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TFF1P04155 84 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CYBAP13498 195 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CCL3L1P16619 93 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CDKN2CP42773 168 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MT4P47944 62 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PCBD1P61457 104 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RGS21Q2M5E4 152 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LXNQ9BS40 222 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LAMB1P07942 1786 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 USH2AO75445 5202 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RYR1P21817 5038 aa-0.43□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms