RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 MGST2Q99735 147 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 IFNA7P01567 189 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00694P0DN24 101 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 MIC13Q5XKP0 118 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 STPG4Q8N801 248 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 GGACTQ9BVM4 153 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 CENPXA8MT69 81 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 TSC22D2O75157 780 aa6.01□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.01□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM8Q96KF7 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 A8MWV9 139 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NBEAP1P0C6P0 100 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 IL7P13232 177 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 FAUP35544 74 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 CHAC2Q8WUX2 184 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 PARLQ9H300 379 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WWL8 130 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 F6UZH7 168 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 PTTG1O95997 202 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 ID3Q02535 119 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 RGS21Q2M5E4 152 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 COX6A2Q02221 97 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 BAXQ07812 192 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 MPV17L2Q567V2 206 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 TMED6Q8WW62 240 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM63Q969Q1 353 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 RHODO00212 210 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 LYRM1O43325 122 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 SFT2D2O95562 160 aa5.97□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 PTH2Q96A98 100 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 NMES1Q9C002 83 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 TREM1Q9NP99 234 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.97□□□□□ -1.45
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SMAD3-211ENST00000559460 L7N2F9 121 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 PLA2G10O15496 165 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 BCAP31P51572 246 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 VAMP2P63027 116 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 IFITM3Q01628 133 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 HYLS1Q96M11 299 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf85Q96MD7 179 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 OR7C2O60412 319 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 ARL16Q0P5N6 197 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 Q9UF83 564 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2D1P51668 147 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R1AQ13522 171 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 ENKURQ8TC29 256 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-211ENST00000559460 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.94□□□□□ -1.46
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