RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01549A6NIU2 74 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 HERVK_113P61574 105 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA25Q9BR10 227 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 GNRH2O43555 120 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV12-3P01733 135 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB1P60022 68 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 MTURNQ8N3F0 131 aa7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 UCNP55089 124 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 USMG5Q96IX5 58 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RELNP78509 3460 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 F6UB75 175 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 NXPH4O95158 308 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 COX6B1P14854 86 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.11□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BUA1 57 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFS8O00217 210 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 APOMO95445 188 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 AGRNO00468 2067 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 CIDEAO60543 219 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2D1P51668 147 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PMVKQ15126 192 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.1□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A087WW49 117 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf86A6NJI1 115 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-69P01742 117 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-11P01762 117 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 CRYGDP07320 174 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM141Q96I45 108 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 KIR2DL4Q99706 377 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SPTBN2O15020 2390 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 VCYO14598 125 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 BRI3O95415 125 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TSPAN13O95857 204 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.09□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 IGIPA6NJ69 53 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 PF4V1P10720 104 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 PSMB2P49721 201 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SPTA1P02549 2419 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 KLLNB2CW77 178 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TSHBP01222 138 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 INSL3P51460 131 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00315P59091 139 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TIMM17AQ99595 171 aa7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0J9YY99 117 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 F5H697 171 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHG2P01859 326 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CD7P09564 240 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ID1P41134 155 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 EMP1P54849 157 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1B0GV72 72 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2D3P61077 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2D2P62837 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXI1Q12951 378 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6EQ16553 131 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CACNA1BQ00975 2339 aa7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A087WWL8 130 aa7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SFTA2Q6UW10 78 aa7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.06□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 JPT2Q9H910 190 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms