RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 APOMO95445 188 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 J3QR89 54 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 SAA4P35542 130 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LY6EQ16553 131 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 Q8N8P6 123 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 NRACQ8N912 160 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.99□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 AKAP9Q99996 3911 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 TGFAP01135 160 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PDE6HQ13956 83 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CNFNQ9BYD5 112 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WX48 190 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 ATP5LO75964 103 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PRTN3P24158 256 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 XGP55808 180 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 FOXI1Q12951 378 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 MRAP2Q96G30 205 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 SIRPDQ9H106 197 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 DPM3Q9P2X0 92 aa6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DRB4P13762 266 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 Q96MF0 132 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LINC01549A6NIU2 74 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LY6LH3BQJ8 138 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LAGE3Q14657 143 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.97□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.96□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 SPINK8P0C7L1 97 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 AJUBAQ96IF1 538 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 PSMB2P49721 201 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 CARD19Q96LW7 228 aa6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 TSPAN13O95857 204 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 LINC01559Q495D7 138 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZS46 218 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 KIR2DL4Q99706 377 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 OR11H12B2RN74 326 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 J3KRW8 73 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 NBR2O15453 112 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 EMP1P54849 157 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MFAP4P55083 255 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 TAL2Q16559 108 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 OR11H1Q8NG94 326 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 OR11H2Q8NH07 326 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 SMR3AQ99954 134 aa6.95□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 CTSGP08311 255 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZUT4 128 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 RNF183Q96D59 192 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 ODF3BA8MYP8 253 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 F8VRH5 84 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 H3BVH4 76 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 IGF1P05019 195 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MSMBP08118 114 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 PRR9Q5T870 116 aa6.94□□□□□ -1.3
THBS3-211ENST00000541990 MAST4O15021 2626 aa6.93□□□□□ -1.3
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