RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 GRIFINA4D1Z8 144 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 B4DEV8 164 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 H3BVH4 76 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 K7EQD1 137 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 C9orf62Q8N4C0 152 aa12.89□□□□□ -0.35
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PTPRU-211ENST00000531385 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 KRBOX1C9JBD0 128 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 RS1O15537 224 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 ASIPP42127 132 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 SULT1A2P50226 295 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.88□□□□□ -0.35
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PTPRU-211ENST00000531385 SLC51BQ86UW2 128 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 NXPH4O95158 308 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 SRIP30626 198 aa12.87□□□□□ -0.35
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PTPRU-211ENST00000531385 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.86□□□□□ -0.35
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PTPRU-211ENST00000531385 ZNF575Q86XF7 245 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 C6orf223Q8N319 242 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 DERL1Q9BUN8 251 aa12.86□□□□□ -0.35
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PTPRU-211ENST00000531385 TNP2Q05952 138 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 BAGE2Q86Y30 109 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 IL36BQ9NZH7 164 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRU-211ENST00000531385 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 LINC01559Q495D7 138 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 PRR27Q6MZM9 219 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 Q6ZSN1 163 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 PTH2Q96A98 100 aa12.83□□□□□ -0.36
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PTPRU-211ENST00000531385 PARLQ9H300 379 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 SIVA1O15304 175 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 RPL35P42766 123 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 TTC32Q5I0X7 151 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 C11orf52Q96A22 123 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 MLST8Q9BVC4 326 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 S100A9P06702 114 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.81□□□□□ -0.36
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PTPRU-211ENST00000531385 CENPWQ5EE01 88 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 Q9UF83 564 aa12.79□□□□□ -0.36
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PTPRU-211ENST00000531385 LINC00315P59091 139 aa12.78□□□□□ -0.36
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PTPRU-211ENST00000531385 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRU-211ENST00000531385 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.78□□□□□ -0.36
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PTPRU-211ENST00000531385 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.77□□□□□ -0.37
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PTPRU-211ENST00000531385 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 SYT8Q8NBV8 401 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 CIDEAO60543 219 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 IGLV2-8P01709 118 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.76□□□□□ -0.37
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PTPRU-211ENST00000531385 GAGE4Q13068 117 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 GAGE5Q13069 117 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 GAGE13Q4V321 117 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 ZFP82Q8N141 532 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 MED9Q9NWA0 146 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 VAX2Q9UIW0 290 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-211ENST00000531385 LY96Q9Y6Y9 160 aa12.74□□□□□ -0.37
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