RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 F8W036 122 aa10.24□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.24□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 M0R036 132 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-53P01767 116 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 P0DMU3 169 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 FAM231AP0DMU4 169 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 FAM231CP0DMU5 169 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 ASIPP42127 132 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 LINC01559Q495D7 138 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 CENPWQ5EE01 88 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 DNLZQ5SXM8 178 aa10.23□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 H3BNG1 76 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF876PQ49A33 203 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF575Q86XF7 245 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 PTH2Q96A98 100 aa10.22□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0J9YY99 117 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 NUDT3O95989 172 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV2-8P01709 118 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 GNG4P50150 75 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 CEBPGP53567 150 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 FHL2Q14192 279 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM12Q96EX1 92 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF479Q96JC4 524 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 IL36BQ9NZH7 164 aa10.21□□□□□ -0.77
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 C9JCJ5 164 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SLAQ13239 276 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 RNF212Q495C1 297 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PRR27Q6MZM9 219 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PARLQ9H300 379 aa10.2□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF727A8MUV8 499 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 H3BVH4 76 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 APOC3P02656 99 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PRO0255Q9UI72 69 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.19□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 RS1O15537 224 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PAX4O43316 350 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CXCL1P09341 107 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CRYBA4P53673 196 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SVBPQ8N300 66 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 VPS13DQ5THJ4 4388 aa10.18□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CIDEAO60543 219 aa10.17□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.17□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.17□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.17□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 NAT8Q9UHE5 227 aa10.17□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 A0A096LPF7 62 aa10.16□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.16□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 MED14OSP0DP75 135 aa10.16□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 BIN3Q9NQY0 253 aa10.16□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.16□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 A8MWV9 139 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SNAPINO95295 136 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CCL18P55774 89 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 SYT8Q8NBV8 401 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.15□□□□□ -0.78
TSTA3-208ENST00000528920 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.14□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 OCC1Q8TAD7 63 aa10.14□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.14□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 ESRGQ1W209 222 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 ZFP82Q8N141 532 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 JPT2Q9H910 190 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 KMT2AQ03164 3969 aa10.13□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.12□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 K7EN84 100 aa10.12□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 M0R381 172 aa10.12□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 SNAI2O43623 268 aa10.12□□□□□ -0.79
TSTA3-208ENST00000528920 P01737 135 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms