RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 STAG3L3P0CL85 134 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 C5orf17Q8NAS9 161 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GAGE12JA6NER3 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GCHFRP30047 84 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GAGE1Q13065 139 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GAGE4Q13068 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GAGE5Q13069 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GAGE13Q4V321 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB24Q969Q5 203 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 Q9UF83 564 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 CIDEAO60543 219 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 SMUG1Q53HV7 270 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 J3QL48 77 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 JPT2Q9H910 190 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 EPDR1Q9UM22 224 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GGTLC3B5MD39 225 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 K7EQM0 130 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFP69Q49AA0 526 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 LINC00479Q96M42 142 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 TM2D2Q9BX73 214 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 PARLQ9H300 379 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 LINC01620Q4KN68 170 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 SUN5Q8TC36 379 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-205ENST00000527952 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 PTTG1O95997 202 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP6V0CP27449 155 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 LAGE3Q14657 143 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 PTH2Q96A98 100 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 BAALCQ8WXS3 180 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 ALG5Q9Y673 324 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 LINC00694P0DN24 101 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 C1QBP02746 253 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM167BQ9NRX6 74 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 A8MWV9 139 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 CXorf1O96002 111 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 Q6ZSA8 131 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRJ-205ENST00000527952 H3BVH4 76 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ASIPP42127 132 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2G2P60604 165 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 IFNA7P01567 189 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 MBP02144 154 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 Q5BKY6 102 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 B4DEV8 164 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 M0R036 132 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 SERF2P84101 59 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 TOR2AQ5JU69 321 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 AQP10Q96PS8 301 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF726P1Q15940 193 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 MED28Q9H204 178 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PRE2 83 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 CRIP1P50238 77 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 SCXQ7RTU7 201 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 Q86TA4 180 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 IL36BQ9NZH7 164 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 KLK12Q9UKR0 248 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A087WWC5 75 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A087WWL8 130 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 PEX7O00628 323 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 NIT1Q86X76 327 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRJ-205ENST00000527952 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms