RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 PTH2Q96A98 100 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9orf85Q96MD7 179 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 C1QBP02746 253 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 STAG3L2P0CL84 134 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 STAG3L3P0CL85 134 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZFP69Q49AA0 526 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 TM2D2Q9BX73 214 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 PSG8Q9UQ74 426 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 GGTLC3B5MD39 225 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV2-11P01706 119 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 GCHFRP30047 84 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMUG1Q53HV7 270 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRNTQ86SH4 94 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 SUN5Q8TC36 379 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB24Q969Q5 203 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 A8MWV9 139 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 DEFA1P59665 94 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 DEFA3P59666 94 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 WFDC2Q14508 124 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZSA8 131 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q8N3U1 123 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 EPDR1Q9UM22 224 aa6.27□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE12JA6NER3 117 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 MBP02144 154 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00694P0DN24 101 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE1Q13065 139 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE4Q13068 117 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE5Q13069 117 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 GAGE13Q4V321 117 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 TOR2AQ5JU69 321 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PARLQ9H300 379 aa6.26□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A087WWC5 75 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 LECT2O14960 151 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 CXorf1O96002 111 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP6V0CP27449 155 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ASIPP42127 132 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SERF2P84101 59 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00479Q96M42 142 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 AQP10Q96PS8 301 aa6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1W2PRE2 83 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 IL36BQ9NZH7 164 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q9UF83 564 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 COX11Q9Y6N1 276 aa6.24□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 RHODO00212 210 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 IFNA7P01567 189 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 BAALCQ8WXS3 180 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 RMI2Q96E14 147 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 JPT2Q9H910 190 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ALG5Q9Y673 324 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.23□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 B4DEV8 164 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BVH4 76 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 PEX7O00628 323 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SEC11BP0C7V7 166 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCXQ7RTU7 201 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q86TA4 180 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 SYT8Q8NBV8 401 aa6.22□□□□□ -1.41
MSC-AS1-210ENST00000524152 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms