RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 F8VRH5 84 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 IGHV4-39P01824 125 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF56Q15929 161 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 Q6Q795 121 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 Q8N8P6 123 aa6.3□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 S4R3C0 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 H7C1H1 209 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 LAGE3Q14657 143 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 MAST4O15021 2626 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 LINC01619G3V211 115 aa6.29□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 IGHV1-2P23083 117 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 DUX3Q96PT4 197 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.28□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.28□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-204ENST00000518858 CCL13Q99616 98 aa6.28□□□□□ -1.4
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CLVS1-204ENST00000518858 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 MSMPQ1L6U9 139 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 HERVK_113P63121 156 aa6.27□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.27□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 A4D1N5 150 aa6.26□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.26□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 LINC01620Q4KN68 170 aa6.25□□□□□ -1.41
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CLVS1-204ENST00000518858 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 H3BMM0 161 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 NDUFA7O95182 113 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 DLX1P56177 255 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 ERCC8Q13216 396 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 UBE2WQ96B02 151 aa6.25□□□□□ -1.41
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM101Q96IK0 257 aa6.25□□□□□ -1.41
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