RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0J9YY99 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.51□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.51□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.51□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 SIGMAR1Q99720 223 aa13.5□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.5□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.5□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 J3QQQ9 107 aa13.5□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 CGB3P0DN86 165 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 NXPH4O95158 308 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV2-14P01704 120 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 COX8AP10176 69 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZWC4 215 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM131Q92545 1883 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.49□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 OBSL1O75147 1896 aa13.48□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 ODF3BA8MYP8 253 aa13.48□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 CGB7P0DN87 165 aa13.48□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 TAL2Q16559 108 aa13.48□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 C9JAW5 83 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 C19orf84I3L1E1 186 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 H3BMM0 161 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 DLEU1O43261 78 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLC2P0DOY2 106 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLC3P0DOY3 106 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 CCL18P55774 89 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 MORN5Q5VZ52 161 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM126AQ9H061 195 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 GAGE2BQ13066 116 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 GAGE2EQ4V326 116 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.47□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EQD1 137 aa13.46□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.46□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 MED14OSP0DP75 135 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 GYPEP15421 78 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2V1Q13404 147 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2WQ96B02 151 aa13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF747Q9BV97 191 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SPINK8P0C7L1 97 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 XCL1P47992 114 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLL1P15814 213 aa13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 E7EUB6 86 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SOCS3O14543 225 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHG4P01861 327 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SIVA1O15304 175 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 HERV-K104P63124 156 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 COX11Q9Y6N1 276 aa13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N1Y9 231 aa13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZQT7 251 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 PRAC2D3DTV9 90 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 GAGE2AQ6NT46 116 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 IGF1P05019 195 aa13.41□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.4□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 P0C879 139 aa13.4□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6YL49 198 aa13.4□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 DKK2Q9UBU2 259 aa13.4□□□□□ -0.26
PTDSS1-202ENST00000517309 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.4□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.4□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 DYSFO75923 2080 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF503Q96F45 646 aa13.39□□□□□ -0.27
PTDSS1-202ENST00000517309 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms