RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 PTH2Q96A98 100 aa11.94□□□□□ -0.5
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ITGA3-215ENST00000515147 CRIP1P50238 77 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-215ENST00000515147 DNLZQ5SXM8 178 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-215ENST00000515147 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.79□□□□□ -0.52
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