RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GGTLC3B5MD39 225 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ZFP69Q49AA0 526 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 Q8N814 137 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 PTH2Q96A98 100 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 CXorf1O96002 111 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 MBP02144 154 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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HERC3-211ENST00000513325 AQP10Q96PS8 301 aa11.29□□□□□ -0.6
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HERC3-211ENST00000513325 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 HERC1Q15751 4861 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZSN1 163 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-211ENST00000513325 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
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HERC3-211ENST00000513325 Q8N3U1 123 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 LINC00479Q96M42 142 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 PARLQ9H300 379 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.26□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 GAGE1Q13065 139 aa11.26□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 GAGE5Q13069 117 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 GAGE13Q4V321 117 aa11.26□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.26□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PRE2 83 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 A8MWV9 139 aa11.25□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 TM2D2Q9BX73 214 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 MED28Q9H204 178 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 LINC00694P0DN24 101 aa11.24□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 Q9UF83 564 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 IFNA7P01567 189 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 ASIPP42127 132 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 ZNF726P1Q15940 193 aa11.23□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-211ENST00000513325 IL36BQ9NZH7 164 aa11.21□□□□□ -0.61
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HERC3-211ENST00000513325 B4DEV8 164 aa11.2□□□□□ -0.62
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HERC3-211ENST00000513325 PTTG1O95997 202 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 C1QBP02746 253 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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HERC3-211ENST00000513325 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.19□□□□□ -0.62
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HERC3-211ENST00000513325 M0R036 132 aa11.19□□□□□ -0.62
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HERC3-211ENST00000513325 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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HERC3-211ENST00000513325 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 FAM74A7A6NL05 159 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 TOR2AQ5JU69 321 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 SYT8Q8NBV8 401 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 MYCBP2O75592 4640 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 RHODO00212 210 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 SH2D1AO60880 128 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 DNLZQ5SXM8 178 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-211ENST00000513325 BAALCQ8WXS3 180 aa11.17□□□□□ -0.62
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