RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 TREM1Q9NP99 234 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 C9JQL5 133 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRAC2D3DTV9 90 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFB4O95168 129 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 GAS8-AS1O95177 125 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 APOC3P02656 99 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 PYYP10082 97 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDKN1BP46527 198 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDE6HQ13956 83 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q8N814 137 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.91□□□□□ -1.62
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 F8W036 122 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 M0R3E3 92 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRYGDP07320 174 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCL20P78556 96 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SERF2P84101 59 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PEA15Q15121 130 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ODF3Q96PU9 254 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SEC11CQ9BY50 192 aa4.9□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GV50 99 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 H7BYZ3 331 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 K7EP13 123 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SFTA3P0C7M3 94 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF415Q09FC8 603 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF726P1Q15940 193 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SVBPQ8N300 66 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SUN5Q8TC36 379 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q9HAA7 133 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FUT9Q9Y231 359 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRELID1Q9Y255 219 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM74A7A6NL05 159 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10J4P0C629 311 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CT45A10P0DMU9 189 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LEPP41159 167 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPT1P50897 306 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TIRAPP58753 221 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAB2AP61019 212 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 BTN1A1Q13410 526 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SCXQ7RTU7 201 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 BLNKQ8WV28 456 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FXYD5Q96DB9 178 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR51M1Q9H341 326 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 KLLNB2CW77 178 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR7C2O60412 319 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNAPINO95295 136 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MBP02144 154 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRISP2P16562 243 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01620Q4KN68 170 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PAXXQ9BUH6 204 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms