RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 ESPL1Q14674 2120 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087WVE0 104 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 WISP1O95388 367 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1D-12P01611 117 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 NRACQ8N912 160 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 F8WEM9 126 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 MORN5Q5VZ52 161 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZVQ6 151 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 Q9Y3F1 56 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-216ENST00000507116 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 E7EUB6 86 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 J3QT63 122 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ADAMTS20P59510 1910 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 GFRA3O60609 400 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ESRGQ1W209 222 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 UBALD1Q8TB05 177 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF134P52741 427 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LAGE3Q14657 143 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 DNAL4O96015 105 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2BP63146 152 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZS46 218 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 Q86TA4 180 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 EPOPA6NHQ4 379 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 VCYO14598 125 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CD70P32970 193 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 THAP8Q8NA92 274 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC2BQ92478 149 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FXYD5Q96DB9 178 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 M0R3E3 92 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 PRR25Q96S07 402 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CEP250Q9BV73 2442 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 COL4A2P08572 1712 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 PRO3102Q9H379 93 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LTBP2Q14767 1821 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 F6UB75 175 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 COX7A2P2O60397 106 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00271P0C7V0 271 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 BLCAPP62952 87 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 MLANAQ16655 118 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF876PQ49A33 203 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf98A8MV24 154 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 Q1T7F1 81 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LCA10Q71F78 164 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 Q9H8V8 135 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 SH2D1AO60880 128 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 A8MUN3 132 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 I3L3M4 83 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01565O15544 149 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 DEFB134Q4QY38 66 aa4.6□□□□□ -1.67
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