RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 BAGE2Q86Y30 109 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SYT8Q8NBV8 401 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RS1O15537 224 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CRIP1P50238 77 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 IL36BQ9NZH7 164 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 A8MWV9 139 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 K7EQD1 137 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CCL20P78556 96 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RTL8CO15255 209 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 C6orf223Q8N319 242 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 H3BVH4 76 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SIVA1O15304 175 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 DNLZQ5SXM8 178 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PPQ1 181 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE6DO43924 150 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC01559Q495D7 138 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NXPH4O95158 308 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOHQ15669 191 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BLOC1S1P78537 153 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR27Q6MZM9 219 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf52Q96A22 123 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MLST8Q9BVC4 326 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 VAX2Q9UIW0 290 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP82Q8N141 532 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PARLQ9H300 379 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MED9Q9NWA0 146 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RHODO00212 210 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BCL2P10415 239 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 M0R381 172 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GNG4P50150 75 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MED14OSP0DP75 135 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CENPWQ5EE01 88 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DERL1Q9BUN8 251 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BIN3Q9NQY0 253 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CXCL1P09341 107 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 EVI2AP22794 236 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SMIM12Q96EX1 92 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GVG6 124 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 K7EP13 123 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TIRAPP58753 221 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SFRP2Q96HF1 295 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB19A4D1S5 217 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 JPT2Q9H910 190 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GVY2 172 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 XKRY2A2RUG3 117 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A087WWL8 130 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TNP2Q05952 138 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZSN1 163 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NFE4Q86UQ8 179 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF575Q86XF7 245 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-210ENST00000505941 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms