RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498008.5

NSUN4-208, Transcript of NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 4, human

TSL 2 BASIC

Gene NSUN4, Length 3,867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSUN4-208	ENST00000498008	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	FOXI1	Q12951	378 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GAGE4	Q13068	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	REV3L	O60673	3130 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		H3BMM0	161 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		K7EIM0	57 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	IFITM1	P13164	125 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GAGE5	Q13069	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GAGE6	Q13070	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	NUP37	Q8NFH4	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		J3QQQ9	107 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	VCY	O14598	125 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	DAND5	Q8N907	189 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		A4D1N5	150 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		K7EM74	188 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PMVK	Q15126	192 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	LINC01587	Q99440	93 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	RBAKDN	A6NC62	111 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	SAA4	P35542	130 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GATA4	P43694	442 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	COL6A3	P12111	3177 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		I3L2K1	104 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	CRIP1	P50238	77 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	CARD19	Q96LW7	228 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	JPT2	Q9H910	190 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		A0A1W2PRX2	142 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	LHB	P01229	141 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PRB1	P04280	392 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	ATP5J2	P56134	94 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	LINC01559	Q495D7	138 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	ZNF883	P0CG24	379 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		A0A0J9YXV3	536 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		H3BUX3	64 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	LINC00158	P58513	81 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008		Q6ZUT4	128 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	PTPRS	Q13332	1948 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NSUN4-208	ENST00000498008	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	OVOL1	O14753	267 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	IGLV2-23	P01705	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	CFC1	P0CG37	223 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	HERV-K104	P63124	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	PAX4	O43316	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	TCL1B	O95988	128 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	THBD	P07204	575 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	TAL2	Q16559	108 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NSUN4-208	ENST00000498008	CTSG	P08311	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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