RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 SYT8Q8NBV8 401 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 SMIM17P0DL12 118 aa7.22□□□□□ -1.25
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