RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496524.5

NPHP1-211, Transcript of nephrocystin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP1, Length 10,006 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1-211ENST00000496524 C16orf74Q96GX8 76 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 B9D2Q9BPU9 175 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 LYNX1P0DP58 116 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 OBSL1O75147 1896 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 K7EQD1 137 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 TFF1P04155 84 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 CSRP2Q16527 193 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 GGNQ86UU5 652 aa6.48□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 K7EN84 100 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 TFF2Q03403 129 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 COX7BP24311 80 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PRR20EP86478 221 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PRR20CP86479 221 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PRR20DP86480 221 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PRR20BP86481 221 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PRR20AP86496 221 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 J3QLI3 93 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 MED14OSP0DP75 135 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 COX7CP15954 63 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 CLEC2BQ92478 149 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.47□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 IGLV3-19P01714 112 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 GNLYP22749 145 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 CCL18P55774 89 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 MIAQ16674 131 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.46□□□□□ -1.37
NPHP1-211ENST00000496524 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 A0A087WW49 117 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 TCL1BO95988 128 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 TET1Q8NFU7 2136 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.46□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 Q8N9L7 120 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MLST8Q9BVC4 326 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MSMBP08118 114 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 GATA4P43694 442 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MT-ATP8P03928 68 aa6.45□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 A0A087WV48 116 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 P0DMU3 169 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 FAM231AP0DMU4 169 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 FAM231CP0DMU5 169 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 RNF138Q8WVD3 245 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 Q8TCH9 128 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 TNCP24821 2201 aa6.44□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 ODF1Q14990 250 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 WDR86Q86TI4 376 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 A0A0J9YXV3 536 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 GNRH2O43555 120 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 ENHOQ6UWT2 76 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 MDFICQ9P1T7 246 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SIPA1L1O43166 1804 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 Q6Q795 121 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 Q9HAA7 133 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 TDRG1Q3Y452 100 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 C14orf177Q52M58 125 aa6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 NCR3O14931 201 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 LINC00205P59089 165 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 Q6ZQT7 251 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 A0A096LPF7 62 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 GYPEP15421 78 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 WT1-ASQ06250 92 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SPRY4Q9C004 299 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 SPAG11BQ08648 103 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 LYPD6Q86Y78 171 aa6.42□□□□□ -1.38
NPHP1-211ENST00000496524 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms