RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 Q6ZSN1 163 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SUN5Q8TC36 379 aa14.79□□□□□ -0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 JPT2Q9H910 190 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRN-215ENST00000484986 Q5BKY6 102 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-215ENST00000484986 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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